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“   SIMULACIÓN DEL CRECIMIENTO POBLACIONAL  A TRAVÉS DEL USO DE AUTÓMATAS CELULARES  DE COLONIAS DE HONGOS EN  CULTIVO  Y CLONES CELULARES   ”
OBJETIVOS  ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
CONCEPTUALIZACIÓN DE AUTÓMATAS CELULARES Y SISTEMAS BIOLÓGICOS
La teoría de los Autómatas Celulares (AC) fue concebida originalmente por Ulam y Von Neuman en los años 40, para proporcionar un marco formal a la investigación del comportamiento de sistemas complejos(una célula, un cerebro, un organismo, una computadora, un ecosistema, un sistema inmunológico o una economía de mercado). Luego ganó popularidad tres décadas más tarde a través de John Conway con su "Juego de la Vida". INTRODUCCI Ó N A LOS AUTÓMATAS CELULARES
¿  QUÉ ES UN AUTÓMATA CELULAR  ?
AUTÓMATA CELULAR espacio  dividido sus estados celdas largo del  tiempo reglas entorno es  un en varía a  lo de acuerdo dependen un estado puede  tomar
Conjunto finito de celdas  distribuidas en una  rejilla n-dimensional Cada celda puede  estar en un único estado en el tiempo El estado de las celdas  cambia de un instante a  otro de acuerdo a un conjunto de reglas El vecindario de  una celda  está   formado por   las celdas   contiguas Las  reglas son  de   estado finito  y controlan   los cambios de estado CARACTERÍSTICAS  DEL  AUTÓMATA CELULAR
COMPONENTES  DE UN  AUTÓMATA  CELULAR Espacio Estado Vecindad Reglas Reloj Virtual Es la matriz dentro de la cual se  expande el modelo simulado   Consiste en asignarle un valor a cada celda del autómata   Es el conjunto contiguo de celdas a cada celda del autómata Es cualquier función que asocie el  conjunto de estados   de un entorno con el estado siguiente de la  celda   Genera pulsos indicando que debe  aplicarse  la regla de evolución y de esta forma cada celda cambiará de estado
ENTORNOS Von Neuman Moore Moore  Extendidos Margolus Celdas  situadas  arriba, abajo  y en los  dos lados.   Incluye las  celdas  diagonales Ce l das   situadas a 2 cuadrados  de distancia Bloques de células ,  se modifican  globalmente
TIPOS  DE AUTÓMATAS  UNIDIMENSIONALES BIDIMENSIONALES  TRIDIMENSIONALES PROBABILÍSTICOS
¿  QUÉ ES UN  SISTEMA BIOLÓGICO ?
[object Object],[object Object]
CLON CELULAR Un clon es una unidad genéticamente igual a la unidad  de la que está clonado, posee las mismas características  genéticas y por lo tanto  la misma función.
[object Object],CICLO CELULAR   FASE G0 No ocurre nada FASE G1 -  Se  dobla  la cantidad de DNA -  Se replican los cromosomas MITOSIS Cromosomas se separan y la célula se divide en dos células (hijas) FASE G2 Continúa el crecimiento celular, por lo que se requiere de proteínas y RNA
HONGO Un hongo es un organismo  unicelular o pluricelular  que se alimenta mediante  la absorción directa  de nutrientes  Re quiere de ciertos factores para la regulación  de su crecimiento y desarrollo
CLASIFICACIÓN DE LOS HONGOS ASCOMICETES BASIDIOMICETES  FICOMICETES MIXOMICETES
La reproducción de los hongos se da a nivel de las esporas que van formando ramificaciones  llamadas hifas,  de esa forma el hongo va creciendo hasta alcanzar una madurez absoluta. Ramificación del hongo REPRODUCCIÓN DE LOS HONGOS
DISEÑO DEL AUTÓMATA CELULAR BIDIMENSIONAL PROBABILÍSTICO
DISEÑO FORMAL  -> CLONES CELULARES 1.   Seguimiento de la reproducción de los clones celulares 2.  Factores que producen el crecimiento y muerte de las células Temperatura CO2 Extracto
INVESTIGACIÓN DE  LABORATORIO
TOXICIDAD  DE CLONES  SUPERVIVIENTES
PREPARACIÓN DE CLONES A SEMBRAR
PREPARAR CAJAS PETRI
PREPARACIÓN DE FRASCOS
PREPARAR MEDIO HAMF 12
EXTRAER MEDIO HAMF 12
COLOCAR HAMF 12 EN FRASCOS DE CÉLULAS
CERRAR FRASCOS DE CÉLULAS
INCUBAR A 37º
QUITAR MEDIO HAMF 12 DEL FRASCO
PREPARACIÓN DE LA CABINA DE RAYOS UV
TRASLADAR CLONES A LAS CAJAS PETRI
COLOCAR CAJAS PETRI EN INCUBADORA
INCUBAR DURANTE 6 DÍAS
COLOCAR CÉLULAS EN EL MICROSCOPIO
VISUALIZAR COLONIAS
COLONIA 1
COLONIA 2
TEÑIR Y CONTAR CLONES CELULARES 1
TEÑIR Y CONTAR CLONES CELULARES 2
3.   Modelo  Matemático  4.   Modelo  Probabilístico 5.  Construcción de Reglas
REGLAS DE CRECIMIENTO  REPRODUCCIÓN ÓPTIMA DE LAS CÉLULAS
REPRODUCCIÓN LENTA DE LAS CÉLULAS
MUERTE LENTA DE LAS CÉLULAS   Muerte de las Células: a) Temperatura 38º, b) Temperatura 39º, c) Temperatura 40º
MUERTE LENTA DE LAS CÉLULAS   Muerte Lenta de las Células sometido a una temperatura de 24º y una dosis de 100 ppm Muerte total de las Células
DISEÑO FORMAL  -> HONGOS EN CULTIVO Temperatura Controlada Medio Temperatura Ambiente 1.   Seguimiento de la reproducción de los hongos en cultivo 2.  Factores que producen el crecimiento y muerte de los hongos
COLONIAS  DE  HONGOS EN CULTIVO
PREPARACIÓN DE MEDIOS
AUTOCLAVAR MEDIOS
ETIQUETAR CAJAS PETRI
CLASIFICAR CAJAS PETRI
ORDENAR CAJAS PETRI
CABINA LISTA PARA SEMBRAR
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SEMBRAR HONGO EN LA CAJA PETRI
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HONGOS SEMBRADOS
ORGANIZAR HONGOS SEMBRADOS
TAMAÑO INICIAL
INCUBADORA 37º
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INCUBADORA 30º
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CLASIFICACIÓN DE HONGOS  SEMBRADOS LUZ Y OSCURIDAD
HONGOS SOMETIDOS A LUZ
HONGOS SOMETIDOS A OSCURIDAD
CRECIMIENTO DE HONGOS SEMBRADOS
HONGOS MUERTOS Y CONGELADOS
3.   Modelo  Estadístico 4.  Construcción de Reglas
REGLAS DE CRECIMIENTO  REPRODUCCIÓN ÓPTIMA DE LOS HONGOS
REPRODUCCIÓN LENTA DE LOS HONGOS
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SIMULACIÓN DEL CRECIMIENTO DE CLONES CELULARES Y COLONIAS DE HONGOS EN CULTIVO
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CARACTERÍSTICAS DE NETLOGO   Multiplataforma Estructura de  Lenguaje simple Constructor de  Interfaz Exporta e importa  funciones
SIMULACIÓN DEL CRECIMIENTO POBLACIONAL DE CLONES CELULARES UTILIZANDO AUTÓMATAS CELULARES
TEMPERATURA = 37 CO2 = 5 DOSIS-EXTRACTO <= 3 REGLAS DE EVOLUCIÓN REPRODUCCIÓN ÓPTIMA DE LAS CÉLULAS
 
TEMPERATURA >= 17 TEMPERATURA <= 20 CO2 = 5 DOSIS-EXTRACTO <= 3 REPRODUCCIÓN LENTA DE LAS CÉLULAS
 
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HONGOS = &quot;54“ TEMPERATURA >= 15 TEMPERATURA <= 17 MEDIO-LUZ = &quot;MYP“ LUZ? = true OSCURIDAD? = false MEDIO-OSCURIDAD = &quot;---“ INCUBADORAS = AMBIENTE REPRODUCCIÓN LENTA DEL HONGO
 
HONGOS = 54 TEMPERATURA <= 5 MEDIO-LUZ = MMNC MEDIO-OSCURIDAD = &quot;---“ INCUBADORAS = &quot;INCUBADORA 5º LUZ? = true OSCURIDAD? = false CONGELACIÓN DEL HONGO
 
HONGOS = 54 TEMPERATURA > 33 MEDIO-LUZ = MYP o MEA o MMNC INCUBADORAS = 37º LUZ? = true OSCURIDAD? = false MEDIO-OSCURIDAD = &quot;---&quot; MUERTE DEL HONGO
 

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