Diapositivas de la presentación oral del Taller "Cienciometría, Información e Informática para Ciencias Biológicas" el día 02 de julio de 2014 en el Anfiteatro Alfredo Barrera de la Facultad de Ciencias, UNAM

1. Taller:
Cienciometría, información e
informática para Ciencias Biológicas
Profesores:
Dra. Layla Michán Aguirre
M. en C. Patricia Magaña Rueda
Biól. Diana Ramírez Álvarez
Biól. Eduardo Alvarez López

3. Disciplina científica especializada en caracterizar, estudiar,
recolectar, sistematizar, preservar, curar, recuperar,
clasificar, evaluar, procesar, compartir, usar, publicar,
visualizar y analizar cualitativa y cuantitativamente por
procesos computacionales la literatura biológica, los
datos y los conocimientos asociados a ésta, de manera
innovadora y óptima para la obtener nuevo conocimiento,
resolver problemas y tomar decisiones.
Informática Biológica

6. Meta-análisis
Manejo
Recuperación
Búsqueda
Métodos
Análisis de las
Ciencias Biológicas
Impacto de la
revolución digital en
biología
Difundir
•Estructura
•Desarrollo
•Tendencias
•Métodos
•Patrones
•Relaciones
Herramientas electrónicasBibliometría
Análisis de redes
Minería de textos
Semántica
Teorías

7. Estudios métricos de la información

8. Objetivo general
El estudiante realizará una investigación de informática
basado en el análisis cuantitativo y cualitativo de
literatura biológica y los metadatos asociados para
resolver un problema biológico en el área de
biomedicina o biodiversidad, durante 2 años (4 niveles)
de taller.

9. Nivel I. Web para Bibliografía
Nivel III. Meta-análisis de
literatura
Nivel II.
Colecciones
bibliográficas
Nivel IV. Tesis

11. Nivel Criterios
I y II 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes
40% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico
40% Trabajo final (Revisión escrita y presentación oral del trabajo)
20% Tareas
III 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes
30% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico
50% Trabajo final: tema de tesis tentativo (Revisión escrita y presentación oral del
trabajo)
20% Tareas
IV 95% Asistencia indispensable para presentar los exámenes
20% Dos exámenes parciales: uno teórico y uno práctico
60% Trabajo final: avance de tesis (pregunta documental, evaluación de colecciones,
hipótesis, método establecido, resultados)
20% Presentación oral de los avances de tesis (Incluyendo resultados)
Evaluación

12. PROYECTOS
ACTUALES

13. Biodiversidad

14. Creacion de colecciones de literatura en biodiversidad
Conceptualización colecciones
Estandarización y curación de información biodiversidad
Establecimiento de metadatos
Objetos digitales
Análisis de la información en biodiversidad
Estudios métricos de la información
Obtención de indicadores bibliométricos
Tendencias de investigación en biodiversidad
Biodiversidad

15. Biomedicina

16. Estructuración de información biomédica
Creación de tesauros
Creación de catálogos
Estándares en biomedicina
Bases de datos biomédicas
Creación de colecciones biomédicas
Ciberinfraestructura en las bases de datos biomédicas
Biomedicina

17. ➢ Creación de tesauros farmacológicos.
➢ Identificación y modificación de plantilla de estándares para curación de
datos farmacológicos.
➢ Diseño de estructura para datos farmacológicos.
➢ Adecuación de estándares internacionales a plantillas y catalogación de
datos farmacológicos.
➢ Curación de datos biomédicos.
➢ Elaboración de vocabularios controlados para reacciones adversas y
efectos secundarios para creación de calculadoras de posología.
➢ Análisis y tendencias de la literatura especializada en biomedicina.
➢ Análisis y recuperación de información de bases de datos biomédicas.
➢ Generación de competencias informacionales para profesionales,
académicos y comunidad que utiliza información para ciencias biomédicas.
Biomedicina

18. ➢ Revisión de temas fármaco-fisio-cardiovasculares
➢ Revisión de patentes para cardiología
➢ Revisión bibliográfica sobre fármaco-fisio-cardiovasculares
➢ Revisión sobre la Superfamilia Conoidea
➢ Revisión de
○ Conotoxinas (Conidae)
○ Augertoxinas (Terebridae)
○ Turritoxinas (Turridae)
➢ Revisión bibliográfica sobre venenos de animales marinos
➢ Revisión de trabajos sobre Venómica de animales marinos
➢ Revisión bibliográfica de polimorfismos (SNP´s) mexicanos
○ Base de datos bibliográfica y SNP´s en cáncer
Biomedicina

20. Mineria de textos
Se refiere al proceso de derivar información de alta calidad a partir de
texto, por medio de la detección de tendencias y patrones cualitativa y
cuantitativamente en documentos.

21. Mineria de textos
Obtención de patrones de reacciones adversas entre medicamentos
oncológicos
Minería de términos estructurados farmacológicos para la
determinación de interacciones
Descubrimiento de conocimiento basado en literatura de recursos no
maderables de importancia forestal en México
Análisis de la colección bibliográfica de la RSMHN por medio de la
minería de textos

22. Semántica
terminología estructura
INTEROPERABLES
Integración de la información
Integración de la terminología

23. Semántica
Las redes de relaciones como fuente de conocimiento, recuperado por web.
● Capa XML: se encuentra en el nivel
inferior y es la que permitirá estructurar
los datos.
● Capa RDF: es la capa siguiente, tiene a
su cargo la definición de la semántica de
los datos.
● Capa Ontology: luego viene la capa que
define las relaciones entre los recursos.
● Capa Logical: es la capa superior y
define las reglas y mecanismos para
hacer inferencias sobre los datos.
● Capas Proof y Trust: ejecutan y evalúan
juntas las reglas de la capa lógica para
determinar la fiabilidad del recurso. Aquí
es donde interviene la firma digital, el
concepto de comercio seguro.
TOMADO DE. Interacciones.com.ar, (2003). Web semántica, ontologias y rdf | Interacciones. [en línea] Disponible
en: http://www.interacciones.com.ar/web-semantica-ontologias-y-rdf/ [Consultado 11 mayo 2014].

24. Resultados
En proceso de titulación
9 tesistas CIIB
2 tesistas en colaboración
Actualmente
6 publicaciones CIIB
5 publicaciones en colaboración

25. Apoyos
Proyecto PAPIME “Web 2.0 y 3.0 para el dominio de la
literatura biológica”
Proyecto CONACYT “El impacto de las Tecnologías de
la Información y la Comunicación (TICs) en las Ciencias
Biológicas 1980-2011”

26. Reunion informativa
Día: Lunes 04 de agosto de 2014
Hora: 10:00 am
Lugar: Laboratorio CIIB Edificio B de Biología Tercer Piso

27. Contacto
Dra. Layla Michán Aguirre
laylamichan@ciibunam.com
M. en C. Patricia Magaña Rueda
patricia@ciibunam.com
Biól. Diana Ramírez Álvarez
coordinacionbiodiversidad@ciibunam.com
Biól. Eduardo Alvarez López
eduardoalvarez@ciibunam.com
Edificio B de Biología Tercer Piso
Tel. 56228222 ext. 44707
http://ciib.unam.mx:8080/