Aims@jcu 2015 amin
•
2 gefällt mir•317 views
Presentation at the annual AIMS@JCU seminar day in 2015. The mutualistic relationship between reef-building corals and intracellular photosynthetic dinoflagellates of the genus Symbiodinium provides the foundation of the coral reef ecosystem. Disruption of this relationship leads to coral bleaching which is occurring on a large scale and poses a real threat to the survival of coral reefs. In spite of the great ecological significance of this partnership to coral reefs, little is currently known about the molecular mechanisms involved in the establishment and maintenance of the symbiosis. A number of studies have investigated host gene expression during the establishment of coral-algal symbiosis, but these have failed to detect host symbiosis-related signals. To better understand the early events occurring during the establishment of symbiosis, infection experiments were conducted during spawning in Sesoko Island, Okinawa, Japan in June 2013 using Acropora digitifera larvae and a competent strain of symbionts, Symbiodinium sp. clade B. Next generation sequencing (Illumina RNAseq) was used for the first time to follow coral transcriptome-wide gene expression after exposure to competent Symbiodinium at 4-, 12-, 48- h post infection. These experiments allowed the detection of transient transcriptomic signals in the coral during the initial infection period. The data imply that the establishment of symbiosis involves cross talk between the partners; an active response is required on the part of the host in order to recognize appropriate partners but at the same time the symbionts appear to suppress some host responses, including immunity
Empfohlen
Empfohlen
Weitere ähnliche Inhalte
Mehr von Amin Mohamed
Mehr von Amin Mohamed (6)
Aims@jcu 2015 amin
- 1. Host Transcriptome Analysis During Onset and Establishment of Coral-Algal Symbiosis Amin R Mohamed ARC CoE Coral Reef Studies, James Cook University AIMS@JCU, Australian Institute of Marine Science AIMS@JCU Student Seminar Day, 2015 18th September 2015
- 2. Rosenberg et al., 2007 The coral holobiontBackground Corals exist in a multipartite symbiosis with • Endosymbiotic algae • Resident microbiota Ø Bacteria Ø Archaea Ø viruses
- 3. Coral-Algal SymbiosisBackground • Symbiodinium is a keystone symbiotic partner to reef-building corals • Up to 95% of the host’s energy requirements (Muscatine et al., 1975)
- 4. Coral Host Transcriptome Response During Establishment Of Coral- Algal Symbiosis Background
- 5. April 5, 2016 5 Background Host responses during Establishment of Coral- Algal Symbiosis Current understanding 5- Disadvantages of the used method Microarrays !!! • Few genes (1000s) • Might be dominated by housekeeping genes 1- Competent Symbiodinium might sneak in…and host doesn’t notice 2- Competent Symbiodinium might suppress host responses 3- Response to symbionts is spatially restricted and hard to detect 4- Previous attempts • Voolstra et al., 2009 ~ 30 min. and 6 days post infection • Schnitzler and Weis 2010 ~ 48 h post infection
- 6. Coral reference Genome and TranscriptomeBackground Indo-pacific corals Acropora millepora Prof David Miller’s lab - JCU Acropora digitifera Prof Nori Satoh’s lab - OIST
- 7. • Using Next generation sequencing (NGS) (illumina RNAseq) to explore the cross talk between host and symbiont during onset of symbiosis • Better understanding the early events occurring during establishment of coral-algal symbiosis • A. digitifera larvae infection with a competent symbiont, Symbiodinium sp. clade B • Quantitatively measure gene expression (using the whole transcriptome) in larvae infected with Symbiodinium compared to to control “aposymbiotic” ones Aims and Objectives Aims Objectives
- 8. The view in front of the marine station, Sesoko Island, Okinawa Methodology Acropora assemblages and spawning Infection experiment Okinawa coral spawning - June/July 2013
- 10. Infection experiment designMethodology Sym B No algae No algae Sym B Sym B No algae Symbiotic Aposymbiotic Ø 6-d old larvae were used ~ with oral pore Ø 700 larvae in 700 ml FSW Ø 2 groups; Symbiotic Vs Aposymbiotic Ø 3 replicate per group Ø Algal cultures (competent Symbiodinium) were added with a final conc. of 3x105 cells/ ml after being washed 3 times in FSW Symbiotic Symbiodinium sp clade B cells Aposymbiotic = control Sampling time points T1= 4h T2= 12h T3= 48h
- 11. Next-gen sequencing (illumina RNAseq) ~ 150 larvae were collected washed in FSW snap frozen in liquid nitrogen and stored at -80°C RNA Integrity Number RIN= 9 Methodology mRNA enrichment 16 cDNA library construction & Illumina (HiSeq 2500) high-throughput sequencing at OIST Total RNA isolation RNA Quality RNA Integrity check using Agilent Bioanalyzer
- 12. Illumina RNAseq Data Analysis Read Mapping~ BOWTIE Transcript Abundance Estimation~ RSEM Differential Gene Expression Analysis edgeR FDR < 0.05 Gene Ontology (GO) Analysis~ DAVID Methodology BIOLOGICAL INSIGHT Enriched processes & Genes of Interest Illumina 100 bp paired-end reads Alignment BAM files Reads count matrix Differentially expressed genes = DEGs A. digitifera Transcriptome
- 13. symbiodiniumB control symbiodiniumB control C1 C2 C3 S2 S1 S3 C1 C2 C3 S2 S1 S3 sample correlation matrix diffExpr.P0.05_C1.matrix.log2 0.9 0.95 1 Value Color Key • Heat map showing samples clustering at 4 h time point • High level of agreement among the biological replicates Results Illumina RNAseq Data • 16 RNAseq libraries (100 bp paired end) • Yield: ~ 200 GB • Total illumina reads: 333 Million Symbiotic | infected Larvae Aposymbiotic | control Larvae
- 14. Mapping reads against the reference A. digitifera transcriptome Results Illumina Reads Mapping A screenshot of Acroproa digitifera transcripts reads alignments of both negative control and Symbiodinium clade B infection reads at 4 h post infection; Using the Integrated Genomics Viewer (IGV)
- 15. Coral Host Transcriptome Profiling at 4, 12, and 48 h post infection Gene expression profiles between the Symbiodinium infected and control larvae The red dots represent the 1073 significant differentially expressed genes (DEGs) detected only at the 4h time point at adjusted P < 0.05 Differential Gene Expression Analysis EdgeRResults Significant DEGs Non-significant DEGs 1073 DEGs No change No change
- 16. DEGs clustering at 4h post Symbiodinium infection symbiodiniumB control C1 C2 C3 S2 S1 S3 adi_EST_assem_11651adi_EST_assem_7958adi_EST_assem_4175adi_EST_assem_27791adi_EST_assem_24670adi_EST_assem_15431adi_EST_assem_35734adi_EST_assem_14233adi_EST_assem_3100adi_EST_assem_15501adi_EST_assem_10958adi_EST_assem_4505adi_EST_assem_16166adi_EST_assem_9847adi_EST_assem_117adi_EST_assem_34039adi_EST_assem_20261adi_EST_assem_19497adi_EST_assem_24279adi_EST_assem_14707adi_EST_assem_11279adi_EST_assem_14856adi_EST_assem_5569adi_EST_assem_5738adi_EST_assem_5350adi_EST_assem_6438adi_EST_assem_4974adi_EST_assem_3850adi_EST_assem_30463adi_EST_assem_27890adi_EST_assem_21171adi_EST_assem_8083adi_EST_assem_8082adi_EST_assem_25541adi_EST_assem_23473adi_EST_assem_3654adi_EST_assem_28572adi_EST_assem_32072adi_EST_assem_5038adi_EST_assem_10220adi_EST_assem_26515adi_EST_assem_9646adi_EST_assem_2898adi_EST_assem_3267adi_EST_assem_3864adi_EST_assem_3374adi_EST_assem_5263adi_EST_assem_10237adi_EST_assem_13833adi_EST_assem_388adi_EST_assem_2340adi_EST_assem_6686adi_EST_assem_7152adi_EST_assem_1121adi_EST_assem_15203adi_EST_assem_3089adi_EST_assem_4958adi_EST_assem_11271adi_EST_assem_17936adi_EST_assem_5429adi_EST_assem_7938adi_EST_assem_9908adi_EST_assem_11310adi_EST_assem_6895adi_EST_assem_6927adi_EST_assem_6408adi_EST_assem_6212adi_EST_assem_17635adi_EST_assem_6809adi_EST_assem_8065adi_EST_assem_9213adi_EST_assem_7479adi_EST_assem_14494adi_EST_assem_15717adi_EST_assem_1236adi_EST_assem_5679adi_EST_assem_8017adi_EST_assem_1783adi_EST_assem_8024adi_EST_assem_23935adi_EST_assem_4095adi_EST_assem_4070adi_EST_assem_17580adi_EST_assem_6313adi_EST_assem_4904adi_EST_assem_4385adi_EST_assem_3752adi_EST_assem_5274adi_EST_assem_33adi_EST_assem_1086adi_EST_assem_54adi_EST_assem_1352adi_EST_assem_6764adi_EST_assem_20728adi_EST_assem_12987adi_EST_assem_259adi_EST_assem_675adi_EST_assem_7220adi_EST_assem_7486adi_EST_assem_9237adi_EST_assem_131adi_EST_assem_9322adi_EST_assem_17304adi_EST_assem_16196adi_EST_assem_12678adi_EST_assem_14041adi_EST_assem_238adi_EST_assem_983adi_EST_assem_6284adi_EST_assem_8045adi_EST_assem_5468adi_EST_assem_2963adi_EST_assem_2066adi_EST_assem_19182adi_EST_assem_25169adi_EST_assem_3734adi_EST_assem_22402adi_EST_assem_2345adi_EST_assem_23118adi_EST_assem_4556adi_EST_assem_226adi_EST_assem_9517adi_EST_assem_24159adi_EST_assem_3776adi_EST_assem_14245adi_EST_assem_14931adi_EST_assem_21394adi_EST_assem_17000adi_EST_assem_14486adi_EST_assem_6697adi_EST_assem_22337adi_EST_assem_17674adi_EST_assem_21418adi_EST_assem_22116adi_EST_assem_17327adi_EST_assem_2270adi_EST_assem_25874adi_EST_assem_13388adi_EST_assem_7793adi_EST_assem_7794adi_EST_assem_10925adi_EST_assem_3425adi_EST_assem_19346adi_EST_assem_10912adi_EST_assem_19316adi_EST_assem_5115adi_EST_assem_14865adi_EST_assem_27416adi_EST_assem_5597adi_EST_assem_3915adi_EST_assem_25422adi_EST_assem_5538adi_EST_assem_13740adi_EST_assem_31632adi_EST_assem_25720adi_EST_assem_10175adi_EST_assem_5495adi_EST_assem_1997adi_EST_assem_11343adi_EST_assem_7749adi_EST_assem_23543adi_EST_assem_10556adi_EST_assem_25811adi_EST_assem_18746adi_EST_assem_10727adi_EST_assem_5753adi_EST_assem_15905adi_EST_assem_6056adi_EST_assem_16483adi_EST_assem_11037adi_EST_assem_7211adi_EST_assem_32585adi_EST_assem_4150adi_EST_assem_5465adi_EST_assem_4692adi_EST_assem_31695adi_EST_assem_4837adi_EST_assem_11539adi_EST_assem_4310adi_EST_assem_10387adi_EST_assem_13950adi_EST_assem_20902adi_EST_assem_5787adi_EST_assem_11281adi_EST_assem_10741adi_EST_assem_11737adi_EST_assem_24899adi_EST_assem_18351adi_EST_assem_3184adi_EST_assem_9430adi_EST_assem_12596adi_EST_assem_14170adi_EST_assem_10518adi_EST_assem_8308adi_EST_assem_32217adi_EST_assem_27242adi_EST_assem_16342adi_EST_assem_5527adi_EST_assem_19215adi_EST_assem_20522adi_EST_assem_8991adi_EST_assem_16094adi_EST_assem_5414adi_EST_assem_5388adi_EST_assem_13911adi_EST_assem_8135adi_EST_assem_29926adi_EST_assem_3521adi_EST_assem_2618adi_EST_assem_10084adi_EST_assem_17780adi_EST_assem_9537adi_EST_assem_26763adi_EST_assem_26250adi_EST_assem_18654adi_EST_assem_19526adi_EST_assem_15509adi_EST_assem_8917adi_EST_assem_5633adi_EST_assem_26407adi_EST_assem_8436adi_EST_assem_4309adi_EST_assem_1475adi_EST_assem_3366adi_EST_assem_6006adi_EST_assem_18666adi_EST_assem_10953adi_EST_assem_1945adi_EST_assem_18051adi_EST_assem_16437adi_EST_assem_9359adi_EST_assem_15028adi_EST_assem_11093adi_EST_assem_4503adi_EST_assem_4754adi_EST_assem_1710adi_EST_assem_1897adi_EST_assem_19633adi_EST_assem_654adi_EST_assem_14524adi_EST_assem_9227adi_EST_assem_23974adi_EST_assem_18284adi_EST_assem_28748adi_EST_assem_4954adi_EST_assem_5199adi_EST_assem_6847adi_EST_assem_2268adi_EST_assem_4134adi_EST_assem_16816adi_EST_assem_3874adi_EST_assem_21133adi_EST_assem_25251adi_EST_assem_7512adi_EST_assem_7821adi_EST_assem_2745adi_EST_assem_3453adi_EST_assem_8650adi_EST_assem_17727adi_EST_assem_8799adi_EST_assem_3513adi_EST_assem_18625adi_EST_assem_11692adi_EST_assem_6702adi_EST_assem_10162adi_EST_assem_424adi_EST_assem_18920adi_EST_assem_8996adi_EST_assem_10377adi_EST_assem_9856adi_EST_assem_15623adi_EST_assem_29512adi_EST_assem_9547adi_EST_assem_16414adi_EST_assem_35878adi_EST_assem_6654adi_EST_assem_6990adi_EST_assem_6452adi_EST_assem_2234adi_EST_assem_7444adi_EST_assem_12249adi_EST_assem_8879adi_EST_assem_17598adi_EST_assem_15634adi_EST_assem_8010adi_EST_assem_6812adi_EST_assem_11025adi_EST_assem_16546adi_EST_assem_15583adi_EST_assem_18144adi_EST_assem_1430adi_EST_assem_7172adi_EST_assem_21525adi_EST_assem_18814adi_EST_assem_7999adi_EST_assem_32678adi_EST_assem_20357adi_EST_assem_6235adi_EST_assem_12983adi_EST_assem_15760adi_EST_assem_6257adi_EST_assem_16400adi_EST_assem_2644adi_EST_assem_13773adi_EST_assem_25678adi_EST_assem_19393adi_EST_assem_4292adi_EST_assem_1351adi_EST_assem_16381adi_EST_assem_11285adi_EST_assem_11131adi_EST_assem_24066adi_EST_assem_14758adi_EST_assem_16389adi_EST_assem_10986adi_EST_assem_30682adi_EST_assem_2165adi_EST_assem_19733adi_EST_assem_2523adi_EST_assem_22992adi_EST_assem_18798adi_EST_assem_22275adi_EST_assem_5901adi_EST_assem_24274adi_EST_assem_11242adi_EST_assem_8176adi_EST_assem_17742adi_EST_assem_22772adi_EST_assem_7960adi_EST_assem_765adi_EST_assem_23854adi_EST_assem_15036adi_EST_assem_17779adi_EST_assem_8293adi_EST_assem_1377adi_EST_assem_14072adi_EST_assem_8093adi_EST_assem_36331adi_EST_assem_5983adi_EST_assem_13534adi_EST_assem_11145adi_EST_assem_10895adi_EST_assem_6441adi_EST_assem_12529adi_EST_assem_21057adi_EST_assem_28960adi_EST_assem_24812adi_EST_assem_18147adi_EST_assem_1805adi_EST_assem_28343adi_EST_assem_5165adi_EST_assem_11938adi_EST_assem_5661adi_EST_assem_907adi_EST_assem_24059adi_EST_assem_7560adi_EST_assem_8905adi_EST_assem_10397adi_EST_assem_7561adi_EST_assem_3285adi_EST_assem_11265adi_EST_assem_11286adi_EST_assem_1731adi_EST_assem_8863adi_EST_assem_16013adi_EST_assem_2190adi_EST_assem_7559adi_EST_assem_29640adi_EST_assem_22228adi_EST_assem_7734adi_EST_assem_27028adi_EST_assem_12325adi_EST_assem_19518adi_EST_assem_17934adi_EST_assem_11477adi_EST_assem_12610adi_EST_assem_15601adi_EST_assem_1403adi_EST_assem_7187adi_EST_assem_5180adi_EST_assem_33998adi_EST_assem_34102adi_EST_assem_17373adi_EST_assem_17251adi_EST_assem_8396adi_EST_assem_22243adi_EST_assem_2899adi_EST_assem_2593adi_EST_assem_5336adi_EST_assem_28adi_EST_assem_15691adi_EST_assem_12444adi_EST_assem_5322adi_EST_assem_707adi_EST_assem_17280adi_EST_assem_10318adi_EST_assem_10669adi_EST_assem_7514adi_EST_assem_11415adi_EST_assem_7730adi_EST_assem_32576adi_EST_assem_19450adi_EST_assem_19135adi_EST_assem_19200adi_EST_assem_9489adi_EST_assem_6095adi_EST_assem_5095adi_EST_assem_12253adi_EST_assem_11541adi_EST_assem_3607adi_EST_assem_6106adi_EST_assem_10891adi_EST_assem_14409adi_EST_assem_4028adi_EST_assem_2005adi_EST_assem_14237adi_EST_assem_7090adi_EST_assem_14469adi_EST_assem_1270adi_EST_assem_8165adi_EST_assem_21329adi_EST_assem_6559adi_EST_assem_17377adi_EST_assem_29809adi_EST_assem_26789adi_EST_assem_120adi_EST_assem_24552adi_EST_assem_7684adi_EST_assem_8429adi_EST_assem_7419adi_EST_assem_5829adi_EST_assem_1099adi_EST_assem_21614adi_EST_assem_10531adi_EST_assem_15997adi_EST_assem_29208adi_EST_assem_5774adi_EST_assem_5557adi_EST_assem_1968adi_EST_assem_13602adi_EST_assem_6496adi_EST_assem_6010adi_EST_assem_22740adi_EST_assem_1827adi_EST_assem_3212adi_EST_assem_2133adi_EST_assem_6961adi_EST_assem_21821adi_EST_assem_8056adi_EST_assem_9134adi_EST_assem_18020adi_EST_assem_9676adi_EST_assem_25364adi_EST_assem_8602adi_EST_assem_14331adi_EST_assem_5310adi_EST_assem_14527adi_EST_assem_73adi_EST_assem_6411adi_EST_assem_3177adi_EST_assem_5272adi_EST_assem_6754adi_EST_assem_7538adi_EST_assem_9808adi_EST_assem_4021adi_EST_assem_26294adi_EST_assem_12817adi_EST_assem_4582adi_EST_assem_4854adi_EST_assem_20771adi_EST_assem_23320adi_EST_assem_2171adi_EST_assem_4729adi_EST_assem_20239adi_EST_assem_28437adi_EST_assem_7150adi_EST_assem_6801adi_EST_assem_11461adi_EST_assem_22461adi_EST_assem_3475adi_EST_assem_1289adi_EST_assem_10686adi_EST_assem_21605adi_EST_assem_4062adi_EST_assem_16950adi_EST_assem_2540adi_EST_assem_1419adi_EST_assem_6953adi_EST_assem_1696adi_EST_assem_5600adi_EST_assem_6942adi_EST_assem_6802adi_EST_assem_2782adi_EST_assem_1110adi_EST_assem_15557adi_EST_assem_18152adi_EST_assem_14216adi_EST_assem_18294adi_EST_assem_3651adi_EST_assem_16476adi_EST_assem_10952adi_EST_assem_5440adi_EST_assem_10825adi_EST_assem_3950adi_EST_assem_3713adi_EST_assem_1948adi_EST_assem_8870adi_EST_assem_4778adi_EST_assem_10127adi_EST_assem_2343adi_EST_assem_7635adi_EST_assem_2887adi_EST_assem_715adi_EST_assem_5898adi_EST_assem_7305adi_EST_assem_4112adi_EST_assem_1510adi_EST_assem_2450adi_EST_assem_9672adi_EST_assem_17299adi_EST_assem_11763adi_EST_assem_9424adi_EST_assem_14339adi_EST_assem_18453adi_EST_assem_26531adi_EST_assem_3072adi_EST_assem_32162adi_EST_assem_2228adi_EST_assem_13811adi_EST_assem_22603adi_EST_assem_26435adi_EST_assem_11705adi_EST_assem_10055adi_EST_assem_6238adi_EST_assem_18588adi_EST_assem_27206adi_EST_assem_141adi_EST_assem_23744adi_EST_assem_23636adi_EST_assem_15378adi_EST_assem_24281adi_EST_assem_11912adi_EST_assem_664adi_EST_assem_6849adi_EST_assem_3458adi_EST_assem_559adi_EST_assem_945adi_EST_assem_2779adi_EST_assem_417adi_EST_assem_711adi_EST_assem_13458adi_EST_assem_5088adi_EST_assem_9498adi_EST_assem_6197adi_EST_assem_8661adi_EST_assem_2453adi_EST_assem_1930adi_EST_assem_6237adi_EST_assem_7669adi_EST_assem_10278adi_EST_assem_4067adi_EST_assem_10551adi_EST_assem_22006adi_EST_assem_375adi_EST_assem_9511adi_EST_assem_7929adi_EST_assem_4877adi_EST_assem_8125adi_EST_assem_5792adi_EST_assem_1285adi_EST_assem_6616adi_EST_assem_7694adi_EST_assem_2524adi_EST_assem_6183adi_EST_assem_4655adi_EST_assem_15257adi_EST_assem_4805adi_EST_assem_609adi_EST_assem_621adi_EST_assem_10002adi_EST_assem_8472adi_EST_assem_6606adi_EST_assem_5646adi_EST_assem_5003adi_EST_assem_4529adi_EST_assem_27735adi_EST_assem_25048adi_EST_assem_19964adi_EST_assem_20179adi_EST_assem_13432adi_EST_assem_2802adi_EST_assem_20125adi_EST_assem_14222adi_EST_assem_27923adi_EST_assem_14784adi_EST_assem_7896adi_EST_assem_5807adi_EST_assem_11584adi_EST_assem_25075adi_EST_assem_2943adi_EST_assem_7729adi_EST_assem_24482adi_EST_assem_14969adi_EST_assem_15984adi_EST_assem_18677adi_EST_assem_13106adi_EST_assem_3247adi_EST_assem_13353adi_EST_assem_25223adi_EST_assem_12361adi_EST_assem_31292adi_EST_assem_9121adi_EST_assem_23106adi_EST_assem_7567adi_EST_assem_25501adi_EST_assem_24200adi_EST_assem_22808adi_EST_assem_7400adi_EST_assem_20730adi_EST_assem_23905adi_EST_assem_30449adi_EST_assem_8782adi_EST_assem_420adi_EST_assem_23670adi_EST_assem_7720 samples vs. features diffExpr.P0.05_C1.matrix.log2.centered −2 0 2 Value Color KeyResults Heat map showing the expression profiles of Symbiodinium infected and control samples Rela7ve expression levels are shown in red (up) and green (down) Suppression of some host genes
- 17. Down-regulated genes Significantly enriched cellular component categories Gene Ontology (GO) Enrichment Analysis Ribonucleoprotein complex 13% Ribosome 11% Organelle membrane 10% Organelle envelope 8% Envelope 8% Organelle inner membrane 6% Mitochondrial membrane 6% Mitochondrial envelope 6% Mitochondrial inner membrane 6% Ribosomal subunit 5% Cytosolic part 4% Respiratory chain 4% Cytosolic ribosome 4% Small ribosomal subunit 3% Cytosolic small ribosomal subunit 3% Mitochondrial membrane part 2% Rough endoplasmic re7culum membrane 1% Results Suppression • Ribosome • ER • Mitochondria
- 18. Coral larvae exhibited varied and significant expression for genes related to: Genes of InterestResults HOST-SYMBIONT INITIAL CONTACT 1. Pattern recognition and cell adhesion proteins (n=17) 2. Immune-related genes (n=5) 3. Transcription regulation (n=21) SYMBIOSIS ESTABLISHMENT 1. Symbiosome formation (n=6) 2. sym32 signaling SYMBIONT TOLERANCE 1. Cell cycle (n=10) 2. Apoptosis (n=11) 3. ROS response (n=13)
- 19. Outcome Host signals during establishment of coral-algal symbiosis i- Host- symbiont initial contact • PRRs- Lectin • Cell adhesion • GP2 and immunity • Ribosomes, ER, and mitochondria ii- Symbiosis Establishment • Symbiosome formation • Sym32 regulation iii-Symbiont tolerance • Apoptosis • Cell cycle • Response to ROS Up regulated Down regulated
- 20. Take Home Messages Ø The experiments allowed the detection of transient transcriptomic signals in the coral during the initial infection period The data imply that: Ø Establishment of symbiosis involves cross talk between the partners Ø An active response is required on the part of the host in order to recognize appropriate partners Ø The symbionts appear to suppress some host responses, including immunity
- 21. Acknowledgement Funding • JCUPRS • AIMS@JCU Top-up Scholarship • Egyptian PhD Scholarship • Prof David Miller lab- Coral Genomics Group -ARC CoE Collaborators • Prof Nori Satoh Lab, Marine Genomics Unit, OIST, Okinawa • Prof Mark Ragan Lab, Computational Biology group, IMB, UQ
- 22. THANK YOU ALL Questions and Comments !!!